Hakさん、こんにちは。
どちらにいっても素敵な職業ですね。

まず医学部の中でも医学科と保健科(看護、検査、作業療法、理学療法等)があります。前者は6年制ですが、後者は4年制です。
歯学部は医学科と同様6年制になります。
話を読む限り、なんとなく医学科のことを考えているのかなと推察しますので、6年制という点はどちらに行っても共通していますね。
それから基礎医学を学ぶ点はどちらに行っても同じでしょう。
歯学部であっても医学の知識は必要ですからね。

医学部と歯学部で根本的に違うのは、将来の職業です。
医学部は医師に、歯学部は歯科医師になる人たちが通うところです。
どちらも他人の体を治す職業ですが、どの部分を治したいかで違ってきます。
医師の中でも、外科なのか内科なのかでも大きく違うでしょう。
小児科や産婦人科といった子供や赤ちゃんを相手にする場合もあります。
なので、まずどういった人たちに接したいかという点を考えてみるといいと思います。

どちらも国家資格を得た後、研修医としてどこかの病院に勤務し、そのまま大きな病院の一医師として勤務するか、どこかのタイミングで開業するかになってきます。
資格もあり、就職の観点から見ると大差ないと思います。

一方、進学の観点で見ると、まず国公立大の歯学部は医学部に比べて圧倒的に少ないです（要は定員が少ない）。
最も医学部の方が進学希望者が多いので倍率で見るとそこまで変わらないかもしれませんが・・・
それから偏差値は医学部医学科の方が高いです。
学力も1つ判断基準になるかもしれませんね。

どちらの学部に行っても将来素敵な職業に就けることを応援しています。