Yuuさん、初めまして。こんにちは！
都内の大学院で建築を専攻している大学院生です。

理科の科目選択、悩みますよね。
科目選択のポイントとしては、
①その選択で、志望校は受験できるかどうか
②現時点でいいので、その科目に対して興味を持っているかどうか（興味ない、本当は全然やりたくない、という場合は、なかなか勉強に身が入らず、成績が上がらない……ということも）
の2つが挙げられると思います。

ご存知かもしれませんが、
【化学＋物理】選択で受験できる学部や学科と【化学＋生物】選択で受験できる学部や学科を比較してみると、前者の方が多く、
また【化学＋生物】でなければ受験できない学部・学科は少ないのに対して、
【化学＋物理】でなければ受験できない学部・学科は割とたくさんあります。
そのことを踏まえて、今一度Yuuさんが志望している・気になっているところの受験科目を確認してみてください。

「工学部だから物理が受験科目に入ってなくても、高校で勉強していなくちゃいけないんだろう！」と思われるかもしれませんが、
もし物理が受験科目として必須でなければ、大学側も高校では物理を選択していなかった人が入学してくる場合があることも分かっていると思うので、
大学入学後に何らかのフォロー（私の大学の場合は、高校の先生が教えてくれる物理の授業があり、物理を取っていなかった人・苦手だった人はその授業を選択していました）があるはずです。
ただ、高校の時から物理の勉強をしている人に比べて短期間で物理の考え方の感覚を得なければならないと思うので、少し大変ではあるかもしれません。

受験科目を確認してみて、物理が必須でなさそうであれば、
次に自分はどちらの方が興味を持てそうかを考えてみるといいかと思います。
上でも書きましたが、平均点がいいからとかみんなが取っているからという理由で全く興味のない科目・そもそも嫌いでやりたくない科目を選んだところで、勉強に身が入らず、平均点は高いけど、自分の点数は低い……ということになりかねません（逆もまた然り）。
生物も物理も、どちらも同じくらいの興味レベルであれば、個人的には物理を選択することをおすすめしますが、
興味レベルが生物と物理で違うのであれば、レベルの高い方を選択するのをお勧めします。

Yuuさんの悩みの解決に、少しでもお役に立てれば幸いです。
頑張ってください。応援しています！