なななこさん、こんにちは☀
たしかに、応用化学を出た人たちは製薬会社に就職する人が多いですが、皆が皆製薬会社に就職するわけではありませんよ。
例えば私が所属している応用化学では、このような就職先になっています。
http://kohka.ch.t.kanazawa-u.ac.jp/graduation/after.html
ちょっとわかりにくいかもしれませんが、大学院を卒業して(大卒ではなかなか研究開発職には就職できない)、化学メーカーに就職していく人が多いです。
どの企業でもほぼ研究開発職として就職していますが、就職先企業はバラバラですね。
実際、就活をしていくと、どこの学部・学科を卒業したかなんて関係ありません。
自分の行きたい企業・業種で就活すれば大丈夫ですよ。

こんにちは！現在応用化学科に通うものです。
応用化学科を卒業すると、製薬会社のみでなく幅広い分野に就職できます。
私の通う大学では、最も多いのは化学・繊維のメーカ―、次いで製薬会社、食品・化粧品会社などです。また、電気・通信など一見応用化学に関係あるの？という分野の企業にも多くの人が就職しています。
応用化学と一言で言っても、製薬に関わるものだけではなく、材料系・生物系・電気系など様々な分野があるので、幅広い分野で卒業生の方々は活躍されています。
また社会の中には大学とは全く異なる分野で活躍されている方もおられます。私がある会社の社員さんとの交流会に参加した際、応用化学科で有機化学を勉強していたけど現在は機械のエンジニアをやっているという方もおられました。
このように先輩方の話を聞いたり、日々授業を受けていく中で、応用化学科は物凄く就職の幅が広いというのを実感しています！
自分の志望する大学の就職先なども一回見てみると良いかもしれません。
こちらの回答が参考になれば幸いです。