こんにちは。
かつて獣医学部を志していたころのイメージで申し訳ありませんが、北大と帯畜であれば、帯畜の方が、産業動物診療の教育に力を入れているような気がします。
ご存じかもしれませんが、平成24年度入学者から北海道大学と帯広畜産大学の共同獣医学課程がスタートしたようです（http://www.vetmed.hokudai.ac.jp/kyoudounew/）ので、また少し変わっているかもしれません。
今後、オープンキャンパスや都内の大学合同説明会でお話を聞くと実際のところがわかるはずなので、積極的に参加してみてください。
さらに、馬の臨床については、JRAが獣医学課程の学生を相手に、サマースクールを開講しているようです（http://www.jra.go.jp/news/201405/052504.html）。
獣医学部進学ののちには、こういったものに参加しても良さそうですね。